Реализованные проекты

Для осуществления расчетов в области теоретической химии НИИ Физики и органической химии Южного Федерального Университета требовался мощный вычислительный комплекс, который мог бы решать разнообразные задачи:

• применение методов математической статистики для анализа разнообразных корреляционных задач, ориентированных, например, на предсказание биологической активности;
• компьютерный дизайн лекарств и катализаторов химических реакций;
• расчет динамических процессов и решение других задач с помощью молекулярного моделирования до расчетов электронного и пространственного строения молекул, их спектральных характеристик и механизмов реакций;
• решение задач квантовой химии, при котором «вычислительный эксперимент» предшествует и дополняет лабораторное исследование или даже заменяет его.

Для проведения подобных «вычислительных экспериментов» требуется большая вычислительная мощность и специализированное программное обеспечение. Установленный компанией ДВ.ком вычислительный комплекс дает пиковую производительность до 5 Тфлопс, что являлось очень приличным показателем среди региональных университетов в 2007 году. На дату 30.03.2010г. по вычислительной мощности система занимала 31-е место в рейтинге TOP50 на Supercomputers.ru (http://top50.supercomputers.ru/?page=archive&rating=12). Для проведения параллельных расчетов требуется быстрая шина между серверами, поэтому для связи серверов использована система InfiniBand QLOGIC 9080 с минимальными задержками. Для расчетов используется специализированное программное обеспечение Gaussian, созданное нобелевским лауреатом Джоном Поплом и его исследовательской группой.

В рамках проекта были осуществлены следующие работы:

• в тесном взаимодействии с заказчиком было разработано решение, которое удовлетворяло всем требованиям заказчика и максимально эффективно решало имеющиеся задачи.
• поставка и пуско-наладка серверной системы Fujitsu-Siemens Primergy BX600, включающей в себя 50 двухпроцессорных блейд-серверов, высокопроизводительной системы хранения Fujitsu-Siemens FibreCATSX80 для хранения результатов вычислений;
• поставка и пуско-наладка системы бесперебойного питания вычислительного комплекса Powerware PW9355-30;
• поставка программного обеспечения Gaussian.